El Instituto de Investigación Sanitaria Getafe se concibe como una estructura funcional de investigación biomédica multidisciplinar y traslacional orientada a la investigación básica clínica, epidemiológica y de servicios de salud.
El Hospital Universitario de Getafe cuenta con instalaciones propias para la actividad investigadora y su gestión. La Plataforma Animal, el Biobanco, las Plataformas Histológica, Clínica o Biológica Celular y Molecular, forman parte de las infraestructuras del Instituto de Investigación.
La actividad investigadora del Insituto de Investigación Sanitaria Getafe se estructura en torno a 5 áreas de investigación que engloban distintas patologías, sistemas y órganos, incluyendo la fragilidad y el envejecimiento, las enfermedades infecciosas, inflamatorias y crónicas y las tecnologías aplicadas a la salud.
La Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital Universitario de Getafe tiene como objetivos principales la promoción de la investigación biomédica, el apoyo a la investigación clínica, la obtención y fondos y gestión de los mismos, así como la difusión de los resultados científicos.